斑鳠,俗名白须魽、芝麻魽,是“珠江四鲜”之一,因其肉质鲜嫩、营养价值高而市场需求旺盛。然而,由于过度捕捞和生态环境恶化,野外群体数量锐减,已于2021年被列入《国家重点保护水生野生动物名录》二级。目前,斑鳠的全人工繁殖与规模化苗种培育技术仍存在瓶颈,在种质资源鉴定、优良性状选育及遗传多样性管理等方面缺乏高效的技术支撑。因此,开发液相基因芯片这种高效、精准的分子工具,可用于快速筛选具有优良性状的亲本、进行家系鉴定以避免近亲繁殖,并监测种群多样性,从而为斑鳠这一物种的可持续发展和野外种群的保护提供较好的技术基础。
在国家淡水水产种质库和佛山市南海国家现代农业产业园等项目支持下,珠江所牟希东研究员团队利用靶向捕获测序技术,成功开发了120252个SNP标记的斑鳠100K液相基因芯片,位点间平均距离为6100bp,完整覆盖整个基因组。该款斑鳠全基因组SNP液相芯片为具有完全自主知识产权的分子标识产品,具备覆盖基因组范围广、通用性强、适用性高等优势,可广泛应用于斑鳠的基因型鉴定、物种亲缘关系分析、种群结构解析、种质资源多样性评估、功能基因挖掘以及遗传育种等多个研究方向。该芯片在保持高准确性和不显著缩小检测范围的前提下,显著缩短了基因型检测周期,并大幅降低了检测成本,为斑鳠的繁殖、种质资源保护及遗传多样性评估提供了高效、可靠的技术支撑。

图1.斑鳠

图2. 基因芯片

图3.基因组分布图